Ученые из Тяньцзиньского института промышленной биотехнологии Китайской академии наук создали автоматизированную платформу генетического редактирования, основанную на алгоритмах искусственного интеллекта. Новая технология позволяет более эффективно прогнозировать точность редактирования и поможет ускорить разработку генетической терапии, говорится в статье, опубликованной в журнале Nature Communications.

Редактор, созданный группой исследователей под руководством профессоров Ван Мэн, Би Чанхао и Чжан Сюэли, позволяет редактировать тысячи образцов клеток в течение недели и открывает новые возможности для лечения генетических заболеваний, вызванных однонуклеотидными вариациями (single nucleotide variant, SNV) в ДНК человека. Такие вариации последовательности генома часто являются причиной аномальных изменений в клетках и вызывают редкие генетические заболевания, среди которых серповидно-клеточная анемия, талассемия, врожденный амавроз Лебера и многие другие. Согласно базе данных ClinVar NCBI, патогенные SNV вызывают развитие более 37 000 известных болезней.

По словам команды, созданная платформа сможет выполнять весь процесс редактирования генома — от проектирования направляющей РНК (гидовой РНК, гРНК) до анализа результатов редактирования — с большей скоростью и меньшими затратами, чем при ручном методе редактирования. Это поможет преодолеть ошибки, связанные с человеческим фактором, а также ускорить и масштабировать процесс.

Созданная платформа также позволяет прогнозировать эффективность редактирования. В статье сообщается, что с ее помощью ученым удалось повысить точность прогнозирования на 20% по сравнению с широко используемой моделью машинного обучения BE-Hive.

Читайте также:

Ученые использовали искусственный интеллект для разработки нового лекарства от бокового амиотрофического склероза

В ожидании орфанной революции: как меняется диагностика и лечение редких болезней

Изображение: Rawpixel.com/Freepik.com